פפטידים הם מחלקה של תרכובות שהמבנה המולקולרי שלהן נמצא בין חומצות אמינו לחלבונים, כלומר חומצות אמינו הן הקבוצות הבסיסיות המהוות פפטידים וחלבונים.בדרך כלל, אלה עם יותר מ-50 שאריות חומצות אמינו נקראות חלבונים, ואלה עם פחות מ-50 נקראות פפטידים, כמו טריפפטידים המורכבים מ-3 חומצות אמינו, טטרפפטידים המורכבים מ-4,וכו.פפטידי סויה עשויים מפולי סויה, קמח סויה או חלבון סויה כחומרי הגלם העיקריים.הם מיוצרים על ידי הידרוליזה אנזימטית או תסיסה מיקרוביאלית.לאחר הפרדה וטיהור מתקבלת תערובת אוליגופפטידים המורכבת מ-3-6 חומצות אמינו, הכוללת גם כמה חומצות אמינו וסוכרים חופשיים..
ההרכב של פפטידים סויה כמעט זהה לזה של חלבון סויה, ויש לו גם מאפיינים של יחס חומצות אמינו מאוזן ותכולה עשירה.בהשוואה לחלבון סויה, לפפטידים של סויה יש יתרונות רבים.קודם כל, לפפטידים של סויה יש את המאפיינים של ללא טעם של שעועית, ללא חומציות, ללא משקעים, ללא התמצקות בחימום, ומסיסים בקלות במים.שנית, קצב הספיגה של פפטידים סויה במעיים טוב, ועיכולו וספיגתו טובים יותר מחלבון סויה.לבסוף, לפפטידים של סויה יש קבוצות פעילות הקושרות ביעילות סידן ויסודות קורט אחרים, ויכולות ליצור קומפלקסים אורגניים של סידן פוליפפטיד, המשפרים משמעותית את המסיסות, קצב הספיגה ומהירות האספקה, ויכולים לקדם ספיגת סידן פסיבית.