פפטיד מולקולה קטנה ממלא תפקיד חשוב בתאים, הוא לא רק מספק חומרי הזנה ותיקון, אלא גם משפר את התפקודים, בינתיים, יש לו אחריות לשאת כלים וחומרים.
פפטידים מולקולריים קטנים משפרים את החדירות של הממברנות המטבוליות הביניים (רירית מערכת העיכול, דופן נימי, מכתשית, קרום קרום המוח, דופן תאי דם אדומים, קרום בסיס גלומרולרי), יכולים לספוג ביעילות חומרי הזנה, להפריש רעלנים ולהגן מפני פלישת פתוגנים.
פפטיד מולקולה קטנה מספקת חומצות אמינו שונות, שיכולות לעזור לגוף לייצר רקמה חדשה שתחליף רקמות פגועות.